九九山莊自110年5月12日起調降每日一般可申請人數為75人，已申請核可者不受影響
因應110年5月11日中央流行疫情指揮中心提升防疫層級至第二級警戒，九九山莊自110年5月12日起調降申請住宿人數至75人，已申請核可者不受影響，其於住宿日前主動提出退費申請者，可退還其住宿費用(但不含必要之匯款手續費)。
*請民眾依退費流程，先至臺灣國家公園入園入山線上申請服務網站(https://npm.cpami.gov.tw/bed_1.aspx)取消訂單，再至本網站申請退費，惟不受理逾住宿日期之退費。
另本處於登山山屋入口實施體溫量測，額溫高於37.5℃或耳溫高於38℃者，勸導其停止登山活動及下山，無法下山者，強制要求其配戴口罩。
山屋入住採實名制，用餐時間需分散，每次用餐人數以30人以下為原則，並請民眾儘量自備餐具、睡袋等登山用品，減少群聚感染機會並維持個人衛生習慣。